NII Plugin

Neste trabalho desenvolvemos um plugin para o software ImageJ (1). O ImageJ é um software para processamento de imagens disponível em domínio público. Ele foi concebido para possuir uma arquitetura aberta e facilmente extensível através de plugins, programados em Java. Ele foi desenvolvido pelo “National Institutes of Health” (2).

O objetivo do plugin é realizar algumas medições para avaliar a morfologia dos núcleos de células presentes em imagens capturadas por um microscópio. O trabalho foi realizado juntamente com o Prof. Manuel Menezes de Oliveira Neto e em parceria com o Prof. Guido Lenz (Instituto de Biociências da UFRGS).

O plugin desenvolvido permitiu que fossem extraídas de forma automatizada informações como a área, perímetro, “roundness” e raio de cada uma das células contidas na imagem. Estes valores são, então, ponderados para gerar uma métrica da irregularidade dos núcleos, permitindo inferir algumas propriedades sobre o estado das células examinadas.

(1) http://rsbweb.nih.gov/ij/
(2) http://www.nih.gov/

Imagens

nii01.png
nii02.png

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